Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3KBP1Q96B97 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3KBP1Q96B97 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3KBP1Q96B97 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3KBP1Q96B97 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3KBP1Q96B97 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3KBP1Q96B97 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3KBP1Q96B97 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SH3KBP1Q96B97 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SH3KBP1Q96B97 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3KBP1Q96B97 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SH3KBP1Q96B97 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3KBP1Q96B97 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3KBP1Q96B97 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3KBP1Q96B97 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3KBP1Q96B97 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3KBP1Q96B97 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3KBP1Q96B97 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3KBP1Q96B97 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SH3KBP1Q96B97 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3KBP1Q96B97 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3KBP1Q96B97 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms