Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NXPE3Q969Y0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NXPE3Q969Y0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NXPE3Q969Y0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NXPE3Q969Y0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NXPE3Q969Y0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NXPE3Q969Y0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NXPE3Q969Y0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NXPE3Q969Y0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NXPE3Q969Y0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NXPE3Q969Y0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NXPE3Q969Y0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NXPE3Q969Y0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NXPE3Q969Y0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NXPE3Q969Y0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NXPE3Q969Y0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NXPE3Q969Y0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NXPE3Q969Y0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NXPE3Q969Y0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NXPE3Q969Y0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NXPE3Q969Y0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NXPE3Q969Y0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NXPE3Q969Y0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NXPE3Q969Y0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NXPE3Q969Y0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NXPE3Q969Y0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NXPE3Q969Y0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NXPE3Q969Y0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NXPE3Q969Y0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NXPE3Q969Y0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms