Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NKD1Q969G9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKD1Q969G9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NKD1Q969G9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 550.4 ms