Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX1Q92499 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX1Q92499 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX1Q92499 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX1Q92499 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX1Q92499 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX1Q92499 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX1Q92499 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX1Q92499 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX1Q92499 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX1Q92499 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX1Q92499 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX1Q92499 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX1Q92499 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX1Q92499 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX1Q92499 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX1Q92499 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX1Q92499 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX1Q92499 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX1Q92499 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX1Q92499 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX1Q92499 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX1Q92499 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX1Q92499 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX1Q92499 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX1Q92499 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX1Q92499 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX1Q92499 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX1Q92499 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX1Q92499 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX1Q92499 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX1Q92499 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX1Q92499 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX1Q92499 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX1Q92499 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX1Q92499 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX1Q92499 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX1Q92499 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX1Q92499 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX1Q92499 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX1Q92499 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX1Q92499 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX1Q92499 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX1Q92499 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX1Q92499 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX1Q92499 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX1Q92499 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX1Q92499 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX1Q92499 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX1Q92499 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX1Q92499 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX1Q92499 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX1Q92499 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DDX1Q92499 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX1Q92499 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX1Q92499 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX1Q92499 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX1Q92499 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX1Q92499 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX1Q92499 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX1Q92499 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX1Q92499 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX1Q92499 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX1Q92499 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX1Q92499 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDX1Q92499 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDX1Q92499 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX1Q92499 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX1Q92499 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX1Q92499 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX1Q92499 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms