Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CKAP2Q8WWK9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP2Q8WWK9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP2Q8WWK9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP2Q8WWK9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP2Q8WWK9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP2Q8WWK9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP2Q8WWK9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKAP2Q8WWK9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CKAP2Q8WWK9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CKAP2Q8WWK9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CKAP2Q8WWK9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CKAP2Q8WWK9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CKAP2Q8WWK9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CKAP2Q8WWK9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CKAP2Q8WWK9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CKAP2Q8WWK9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CKAP2Q8WWK9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CKAP2Q8WWK9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CKAP2Q8WWK9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CKAP2Q8WWK9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CKAP2Q8WWK9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CKAP2Q8WWK9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKAP2Q8WWK9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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