Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC4Q8WW27 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC4Q8WW27 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOBEC4Q8WW27 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms