Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBY8

PMFBP1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMFBP1Q8TBY8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PMFBP1Q8TBY8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PMFBP1Q8TBY8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PMFBP1Q8TBY8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PMFBP1Q8TBY8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PMFBP1Q8TBY8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PMFBP1Q8TBY8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PMFBP1Q8TBY8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PMFBP1Q8TBY8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PMFBP1Q8TBY8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PMFBP1Q8TBY8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PMFBP1Q8TBY8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PMFBP1Q8TBY8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
PMFBP1Q8TBY8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
PMFBP1Q8TBY8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PMFBP1Q8TBY8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PMFBP1Q8TBY8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PMFBP1Q8TBY8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PMFBP1Q8TBY8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PMFBP1Q8TBY8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PMFBP1Q8TBY8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PMFBP1Q8TBY8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PMFBP1Q8TBY8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PMFBP1Q8TBY8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PMFBP1Q8TBY8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PMFBP1Q8TBY8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
PMFBP1Q8TBY8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PMFBP1Q8TBY8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PMFBP1Q8TBY8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PMFBP1Q8TBY8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PMFBP1Q8TBY8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PMFBP1Q8TBY8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PMFBP1Q8TBY8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PMFBP1Q8TBY8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PMFBP1Q8TBY8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PMFBP1Q8TBY8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PMFBP1Q8TBY8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PMFBP1Q8TBY8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PMFBP1Q8TBY8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PMFBP1Q8TBY8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PMFBP1Q8TBY8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
PMFBP1Q8TBY8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PMFBP1Q8TBY8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PMFBP1Q8TBY8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PMFBP1Q8TBY8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PMFBP1Q8TBY8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PMFBP1Q8TBY8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PMFBP1Q8TBY8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PMFBP1Q8TBY8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms