Protein–RNA interactions for Protein: Q8NGH8

OR56A4, Olfactory receptor 56A4, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OR56A4Q8NGH8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OR56A4Q8NGH8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OR56A4Q8NGH8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OR56A4Q8NGH8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OR56A4Q8NGH8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OR56A4Q8NGH8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OR56A4Q8NGH8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OR56A4Q8NGH8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OR56A4Q8NGH8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OR56A4Q8NGH8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OR56A4Q8NGH8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OR56A4Q8NGH8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OR56A4Q8NGH8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OR56A4Q8NGH8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OR56A4Q8NGH8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OR56A4Q8NGH8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OR56A4Q8NGH8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OR56A4Q8NGH8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OR56A4Q8NGH8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
OR56A4Q8NGH8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OR56A4Q8NGH8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OR56A4Q8NGH8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OR56A4Q8NGH8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OR56A4Q8NGH8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OR56A4Q8NGH8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OR56A4Q8NGH8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OR56A4Q8NGH8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OR56A4Q8NGH8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OR56A4Q8NGH8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OR56A4Q8NGH8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OR56A4Q8NGH8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OR56A4Q8NGH8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OR56A4Q8NGH8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
OR56A4Q8NGH8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OR56A4Q8NGH8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OR56A4Q8NGH8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OR56A4Q8NGH8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OR56A4Q8NGH8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OR56A4Q8NGH8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OR56A4Q8NGH8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms