Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KNL1Q8NG31 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KNL1Q8NG31 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNL1Q8NG31 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms