Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP3

DNAAF1, Dynein assembly factor 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF1Q8NEP3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF1Q8NEP3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF1Q8NEP3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF1Q8NEP3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF1Q8NEP3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms