Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPC24Q8NBT2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPC24Q8NBT2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPC24Q8NBT2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPC24Q8NBT2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPC24Q8NBT2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPC24Q8NBT2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPC24Q8NBT2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPC24Q8NBT2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SPC24Q8NBT2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPC24Q8NBT2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPC24Q8NBT2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SPC24Q8NBT2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPC24Q8NBT2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPC24Q8NBT2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPC24Q8NBT2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPC24Q8NBT2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SPC24Q8NBT2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPC24Q8NBT2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPC24Q8NBT2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPC24Q8NBT2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPC24Q8NBT2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPC24Q8NBT2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPC24Q8NBT2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPC24Q8NBT2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPC24Q8NBT2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SPC24Q8NBT2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPC24Q8NBT2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPC24Q8NBT2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPC24Q8NBT2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPC24Q8NBT2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPC24Q8NBT2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPC24Q8NBT2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPC24Q8NBT2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPC24Q8NBT2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPC24Q8NBT2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPC24Q8NBT2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPC24Q8NBT2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPC24Q8NBT2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPC24Q8NBT2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPC24Q8NBT2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPC24Q8NBT2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SPC24Q8NBT2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPC24Q8NBT2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPC24Q8NBT2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPC24Q8NBT2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPC24Q8NBT2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPC24Q8NBT2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPC24Q8NBT2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPC24Q8NBT2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPC24Q8NBT2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPC24Q8NBT2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SPC24Q8NBT2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPC24Q8NBT2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPC24Q8NBT2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPC24Q8NBT2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPC24Q8NBT2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPC24Q8NBT2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPC24Q8NBT2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPC24Q8NBT2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPC24Q8NBT2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms