Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9S9

SNX31, Sorting nexin-31, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX31Q8N9S9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX31Q8N9S9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX31Q8N9S9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX31Q8N9S9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms