Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ5

TRIM42, Tripartite motif-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM42Q8IWZ5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM42Q8IWZ5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM42Q8IWZ5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM42Q8IWZ5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM42Q8IWZ5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM42Q8IWZ5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM42Q8IWZ5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM42Q8IWZ5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM42Q8IWZ5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM42Q8IWZ5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM42Q8IWZ5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM42Q8IWZ5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM42Q8IWZ5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM42Q8IWZ5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM42Q8IWZ5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM42Q8IWZ5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM42Q8IWZ5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM42Q8IWZ5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM42Q8IWZ5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM42Q8IWZ5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM42Q8IWZ5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM42Q8IWZ5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM42Q8IWZ5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM42Q8IWZ5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM42Q8IWZ5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM42Q8IWZ5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM42Q8IWZ5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM42Q8IWZ5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM42Q8IWZ5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM42Q8IWZ5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM42Q8IWZ5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM42Q8IWZ5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM42Q8IWZ5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM42Q8IWZ5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM42Q8IWZ5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM42Q8IWZ5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM42Q8IWZ5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM42Q8IWZ5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM42Q8IWZ5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM42Q8IWZ5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms