Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
METAP1DQ6UB28 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
METAP1DQ6UB28 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
METAP1DQ6UB28 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
METAP1DQ6UB28 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
METAP1DQ6UB28 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
METAP1DQ6UB28 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
METAP1DQ6UB28 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
METAP1DQ6UB28 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
METAP1DQ6UB28 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
METAP1DQ6UB28 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
METAP1DQ6UB28 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
METAP1DQ6UB28 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
METAP1DQ6UB28 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
METAP1DQ6UB28 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
METAP1DQ6UB28 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
METAP1DQ6UB28 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
METAP1DQ6UB28 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
METAP1DQ6UB28 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
METAP1DQ6UB28 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
METAP1DQ6UB28 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
METAP1DQ6UB28 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms