Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
USP17L2Q6R6M4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP17L2Q6R6M4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP17L2Q6R6M4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
USP17L2Q6R6M4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP17L2Q6R6M4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP17L2Q6R6M4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP17L2Q6R6M4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP17L2Q6R6M4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP17L2Q6R6M4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L2Q6R6M4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L2Q6R6M4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L2Q6R6M4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L2Q6R6M4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP17L2Q6R6M4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP17L2Q6R6M4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP17L2Q6R6M4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP17L2Q6R6M4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP17L2Q6R6M4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
USP17L2Q6R6M4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP17L2Q6R6M4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP17L2Q6R6M4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP17L2Q6R6M4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP17L2Q6R6M4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP17L2Q6R6M4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP17L2Q6R6M4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP17L2Q6R6M4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP17L2Q6R6M4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP17L2Q6R6M4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
USP17L2Q6R6M4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP17L2Q6R6M4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP17L2Q6R6M4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
USP17L2Q6R6M4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP17L2Q6R6M4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP17L2Q6R6M4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP17L2Q6R6M4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP17L2Q6R6M4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP17L2Q6R6M4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
USP17L2Q6R6M4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
USP17L2Q6R6M4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP17L2Q6R6M4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP17L2Q6R6M4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
USP17L2Q6R6M4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
USP17L2Q6R6M4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
USP17L2Q6R6M4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms