Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
LMOD2Q6P5Q4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
LMOD2Q6P5Q4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LMOD2Q6P5Q4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LMOD2Q6P5Q4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LMOD2Q6P5Q4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LMOD2Q6P5Q4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
LMOD2Q6P5Q4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
LMOD2Q6P5Q4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LMOD2Q6P5Q4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
LMOD2Q6P5Q4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
LMOD2Q6P5Q4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LMOD2Q6P5Q4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LMOD2Q6P5Q4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
LMOD2Q6P5Q4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LMOD2Q6P5Q4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35■■■■□ 3.19
LMOD2Q6P5Q4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
LMOD2Q6P5Q4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LMOD2Q6P5Q4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
LMOD2Q6P5Q4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LMOD2Q6P5Q4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LMOD2Q6P5Q4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LMOD2Q6P5Q4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
LMOD2Q6P5Q4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
LMOD2Q6P5Q4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
LMOD2Q6P5Q4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
LMOD2Q6P5Q4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
LMOD2Q6P5Q4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
LMOD2Q6P5Q4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
LMOD2Q6P5Q4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
LMOD2Q6P5Q4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
LMOD2Q6P5Q4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
LMOD2Q6P5Q4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LMOD2Q6P5Q4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
LMOD2Q6P5Q4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LMOD2Q6P5Q4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LMOD2Q6P5Q4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
LMOD2Q6P5Q4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
LMOD2Q6P5Q4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
LMOD2Q6P5Q4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
LMOD2Q6P5Q4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LMOD2Q6P5Q4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LMOD2Q6P5Q4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LMOD2Q6P5Q4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LMOD2Q6P5Q4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LMOD2Q6P5Q4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LMOD2Q6P5Q4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
LMOD2Q6P5Q4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LMOD2Q6P5Q4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LMOD2Q6P5Q4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LMOD2Q6P5Q4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
LMOD2Q6P5Q4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LMOD2Q6P5Q4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LMOD2Q6P5Q4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
LMOD2Q6P5Q4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
LMOD2Q6P5Q4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
LMOD2Q6P5Q4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
LMOD2Q6P5Q4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LMOD2Q6P5Q4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
LMOD2Q6P5Q4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
LMOD2Q6P5Q4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
LMOD2Q6P5Q4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
LMOD2Q6P5Q4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
LMOD2Q6P5Q4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
LMOD2Q6P5Q4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
LMOD2Q6P5Q4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
LMOD2Q6P5Q4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
LMOD2Q6P5Q4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LMOD2Q6P5Q4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
LMOD2Q6P5Q4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LMOD2Q6P5Q4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
LMOD2Q6P5Q4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
LMOD2Q6P5Q4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LMOD2Q6P5Q4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
LMOD2Q6P5Q4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
LMOD2Q6P5Q4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LMOD2Q6P5Q4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
LMOD2Q6P5Q4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
LMOD2Q6P5Q4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LMOD2Q6P5Q4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
LMOD2Q6P5Q4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LMOD2Q6P5Q4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LMOD2Q6P5Q4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
LMOD2Q6P5Q4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
LMOD2Q6P5Q4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
LMOD2Q6P5Q4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
LMOD2Q6P5Q4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
LMOD2Q6P5Q4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
LMOD2Q6P5Q4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
LMOD2Q6P5Q4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
LMOD2Q6P5Q4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
LMOD2Q6P5Q4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
LMOD2Q6P5Q4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
LMOD2Q6P5Q4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LMOD2Q6P5Q4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LMOD2Q6P5Q4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LMOD2Q6P5Q4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
LMOD2Q6P5Q4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LMOD2Q6P5Q4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
LMOD2Q6P5Q4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms