Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRNP1Q6NT89 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRNP1Q6NT89 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRNP1Q6NT89 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRNP1Q6NT89 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRNP1Q6NT89 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRNP1Q6NT89 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRNP1Q6NT89 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRNP1Q6NT89 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRNP1Q6NT89 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRNP1Q6NT89 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRNP1Q6NT89 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRNP1Q6NT89 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRNP1Q6NT89 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRNP1Q6NT89 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRNP1Q6NT89 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRNP1Q6NT89 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRNP1Q6NT89 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRNP1Q6NT89 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRNP1Q6NT89 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRNP1Q6NT89 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRNP1Q6NT89 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRNP1Q6NT89 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRNP1Q6NT89 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRNP1Q6NT89 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRNP1Q6NT89 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRNP1Q6NT89 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRNP1Q6NT89 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRNP1Q6NT89 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRNP1Q6NT89 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRNP1Q6NT89 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRNP1Q6NT89 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms