Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL6Q6ICC9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL6Q6ICC9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms