Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
E4F1Q66K89 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
E4F1Q66K89 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
E4F1Q66K89 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
E4F1Q66K89 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
E4F1Q66K89 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
E4F1Q66K89 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
E4F1Q66K89 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
E4F1Q66K89 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
E4F1Q66K89 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
E4F1Q66K89 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
E4F1Q66K89 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
E4F1Q66K89 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
E4F1Q66K89 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
E4F1Q66K89 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
E4F1Q66K89 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
E4F1Q66K89 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
E4F1Q66K89 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
E4F1Q66K89 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
E4F1Q66K89 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
E4F1Q66K89 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
E4F1Q66K89 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
E4F1Q66K89 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
E4F1Q66K89 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
E4F1Q66K89 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
E4F1Q66K89 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
E4F1Q66K89 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
E4F1Q66K89 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms