Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKR4

OTP, Homeobox protein orthopedia, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTPQ5XKR4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTPQ5XKR4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTPQ5XKR4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTPQ5XKR4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTPQ5XKR4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTPQ5XKR4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
OTPQ5XKR4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTPQ5XKR4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTPQ5XKR4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms