Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QL3Q5VWW1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QL3Q5VWW1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QL3Q5VWW1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1QL3Q5VWW1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QL3Q5VWW1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QL3Q5VWW1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QL3Q5VWW1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QL3Q5VWW1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QL3Q5VWW1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QL3Q5VWW1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QL3Q5VWW1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QL3Q5VWW1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QL3Q5VWW1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1QL3Q5VWW1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1QL3Q5VWW1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1QL3Q5VWW1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1QL3Q5VWW1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1QL3Q5VWW1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C1QL3Q5VWW1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1QL3Q5VWW1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QL3Q5VWW1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms