Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
RSPH4AQ5TD94 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
RSPH4AQ5TD94 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
RSPH4AQ5TD94 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
RSPH4AQ5TD94 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
RSPH4AQ5TD94 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
RSPH4AQ5TD94 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
RSPH4AQ5TD94 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
RSPH4AQ5TD94 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
RSPH4AQ5TD94 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
RSPH4AQ5TD94 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
RSPH4AQ5TD94 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
RSPH4AQ5TD94 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
RSPH4AQ5TD94 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
RSPH4AQ5TD94 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
RSPH4AQ5TD94 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
RSPH4AQ5TD94 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
RSPH4AQ5TD94 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
RSPH4AQ5TD94 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
RSPH4AQ5TD94 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
RSPH4AQ5TD94 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
RSPH4AQ5TD94 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
RSPH4AQ5TD94 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
RSPH4AQ5TD94 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
RSPH4AQ5TD94 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
RSPH4AQ5TD94 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
RSPH4AQ5TD94 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
RSPH4AQ5TD94 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
RSPH4AQ5TD94 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
RSPH4AQ5TD94 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
RSPH4AQ5TD94 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
RSPH4AQ5TD94 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
RSPH4AQ5TD94 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
RSPH4AQ5TD94 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
RSPH4AQ5TD94 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
RSPH4AQ5TD94 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
RSPH4AQ5TD94 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC38.52■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC38.51■■■■□ 3.76
RSPH4AQ5TD94 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
RSPH4AQ5TD94 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
RSPH4AQ5TD94 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
RSPH4AQ5TD94 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
RSPH4AQ5TD94 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
RSPH4AQ5TD94 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
RSPH4AQ5TD94 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RSPH4AQ5TD94 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
RSPH4AQ5TD94 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
RSPH4AQ5TD94 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
RSPH4AQ5TD94 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
RSPH4AQ5TD94 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
RSPH4AQ5TD94 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
RSPH4AQ5TD94 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
RSPH4AQ5TD94 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
RSPH4AQ5TD94 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
RSPH4AQ5TD94 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
RSPH4AQ5TD94 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
RSPH4AQ5TD94 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
RSPH4AQ5TD94 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
RSPH4AQ5TD94 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
RSPH4AQ5TD94 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
RSPH4AQ5TD94 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
RSPH4AQ5TD94 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
RSPH4AQ5TD94 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
RSPH4AQ5TD94 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
RSPH4AQ5TD94 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
RSPH4AQ5TD94 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
RSPH4AQ5TD94 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
RSPH4AQ5TD94 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
RSPH4AQ5TD94 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
RSPH4AQ5TD94 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
RSPH4AQ5TD94 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RSPH4AQ5TD94 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RSPH4AQ5TD94 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RSPH4AQ5TD94 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RSPH4AQ5TD94 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
RSPH4AQ5TD94 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RSPH4AQ5TD94 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms