Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LDLRAP1Q5SW96 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAP1Q5SW96 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDLRAP1Q5SW96 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms