Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RTL5Q5HYW3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RTL5Q5HYW3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
RTL5Q5HYW3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RTL5Q5HYW3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RTL5Q5HYW3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RTL5Q5HYW3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RTL5Q5HYW3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RTL5Q5HYW3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RTL5Q5HYW3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RTL5Q5HYW3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RTL5Q5HYW3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RTL5Q5HYW3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RTL5Q5HYW3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
RTL5Q5HYW3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RTL5Q5HYW3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RTL5Q5HYW3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RTL5Q5HYW3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RTL5Q5HYW3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RTL5Q5HYW3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
RTL5Q5HYW3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RTL5Q5HYW3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RTL5Q5HYW3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RTL5Q5HYW3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RTL5Q5HYW3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RTL5Q5HYW3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RTL5Q5HYW3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RTL5Q5HYW3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RTL5Q5HYW3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RTL5Q5HYW3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RTL5Q5HYW3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RTL5Q5HYW3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RTL5Q5HYW3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RTL5Q5HYW3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RTL5Q5HYW3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RTL5Q5HYW3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RTL5Q5HYW3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RTL5Q5HYW3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RTL5Q5HYW3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RTL5Q5HYW3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RTL5Q5HYW3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RTL5Q5HYW3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RTL5Q5HYW3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RTL5Q5HYW3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RTL5Q5HYW3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RTL5Q5HYW3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RTL5Q5HYW3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
RTL5Q5HYW3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RTL5Q5HYW3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RTL5Q5HYW3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RTL5Q5HYW3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RTL5Q5HYW3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
RTL5Q5HYW3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RTL5Q5HYW3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RTL5Q5HYW3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RTL5Q5HYW3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RTL5Q5HYW3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RTL5Q5HYW3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RTL5Q5HYW3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
RTL5Q5HYW3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RTL5Q5HYW3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RTL5Q5HYW3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RTL5Q5HYW3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RTL5Q5HYW3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RTL5Q5HYW3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RTL5Q5HYW3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RTL5Q5HYW3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RTL5Q5HYW3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
RTL5Q5HYW3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RTL5Q5HYW3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RTL5Q5HYW3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RTL5Q5HYW3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
RTL5Q5HYW3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RTL5Q5HYW3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RTL5Q5HYW3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RTL5Q5HYW3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RTL5Q5HYW3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RTL5Q5HYW3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RTL5Q5HYW3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RTL5Q5HYW3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RTL5Q5HYW3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RTL5Q5HYW3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RTL5Q5HYW3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RTL5Q5HYW3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RTL5Q5HYW3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RTL5Q5HYW3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RTL5Q5HYW3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RTL5Q5HYW3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RTL5Q5HYW3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms