Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWF7

FBXO48, F-box only protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO48Q5FWF7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO48Q5FWF7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO48Q5FWF7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO48Q5FWF7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO48Q5FWF7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO48Q5FWF7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO48Q5FWF7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO48Q5FWF7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO48Q5FWF7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO48Q5FWF7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FBXO48Q5FWF7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO48Q5FWF7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms