Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFT2D3Q587I9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SFT2D3Q587I9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFT2D3Q587I9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SFT2D3Q587I9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFT2D3Q587I9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFT2D3Q587I9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFT2D3Q587I9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFT2D3Q587I9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFT2D3Q587I9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SFT2D3Q587I9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFT2D3Q587I9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFT2D3Q587I9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFT2D3Q587I9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFT2D3Q587I9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFT2D3Q587I9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFT2D3Q587I9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SFT2D3Q587I9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFT2D3Q587I9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFT2D3Q587I9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFT2D3Q587I9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFT2D3Q587I9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFT2D3Q587I9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SFT2D3Q587I9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFT2D3Q587I9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFT2D3Q587I9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFT2D3Q587I9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFT2D3Q587I9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFT2D3Q587I9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFT2D3Q587I9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFT2D3Q587I9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFT2D3Q587I9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFT2D3Q587I9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFT2D3Q587I9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFT2D3Q587I9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFT2D3Q587I9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFT2D3Q587I9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SFT2D3Q587I9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFT2D3Q587I9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFT2D3Q587I9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFT2D3Q587I9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFT2D3Q587I9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFT2D3Q587I9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFT2D3Q587I9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFT2D3Q587I9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFT2D3Q587I9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms