Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4orf17Q53FE4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf17Q53FE4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf17Q53FE4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf17Q53FE4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf17Q53FE4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf17Q53FE4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf17Q53FE4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf17Q53FE4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf17Q53FE4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf17Q53FE4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf17Q53FE4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf17Q53FE4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf17Q53FE4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf17Q53FE4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf17Q53FE4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf17Q53FE4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf17Q53FE4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms