Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FNDC1Q4ZHG4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FNDC1Q4ZHG4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FNDC1Q4ZHG4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FNDC1Q4ZHG4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FNDC1Q4ZHG4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FNDC1Q4ZHG4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FNDC1Q4ZHG4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FNDC1Q4ZHG4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FNDC1Q4ZHG4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FNDC1Q4ZHG4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FNDC1Q4ZHG4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FNDC1Q4ZHG4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FNDC1Q4ZHG4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FNDC1Q4ZHG4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FNDC1Q4ZHG4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FNDC1Q4ZHG4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FNDC1Q4ZHG4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FNDC1Q4ZHG4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FNDC1Q4ZHG4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FNDC1Q4ZHG4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FNDC1Q4ZHG4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FNDC1Q4ZHG4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FNDC1Q4ZHG4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FNDC1Q4ZHG4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.4 ms