Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRIT3Q3SXY7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRIT3Q3SXY7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRIT3Q3SXY7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRIT3Q3SXY7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRIT3Q3SXY7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRIT3Q3SXY7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRIT3Q3SXY7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LRIT3Q3SXY7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRIT3Q3SXY7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LRIT3Q3SXY7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRIT3Q3SXY7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LRIT3Q3SXY7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRIT3Q3SXY7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRIT3Q3SXY7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRIT3Q3SXY7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LRIT3Q3SXY7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRIT3Q3SXY7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRIT3Q3SXY7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRIT3Q3SXY7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LRIT3Q3SXY7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRIT3Q3SXY7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LRIT3Q3SXY7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRIT3Q3SXY7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms