Protein–RNA interactions for Protein: Q1HG43

DUOXA1, Dual oxidase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOXA1Q1HG43 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOXA1Q1HG43 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUOXA1Q1HG43 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DUOXA1Q1HG43 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DUOXA1Q1HG43 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUOXA1Q1HG43 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUOXA1Q1HG43 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUOXA1Q1HG43 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUOXA1Q1HG43 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DUOXA1Q1HG43 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUOXA1Q1HG43 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUOXA1Q1HG43 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DUOXA1Q1HG43 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUOXA1Q1HG43 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUOXA1Q1HG43 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUOXA1Q1HG43 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms