Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms