Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
EXOSC2Q13868 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXOSC2Q13868 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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