Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MADCAM1Q13477 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MADCAM1Q13477 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MADCAM1Q13477 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MADCAM1Q13477 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MADCAM1Q13477 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MADCAM1Q13477 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MADCAM1Q13477 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MADCAM1Q13477 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MADCAM1Q13477 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MADCAM1Q13477 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MADCAM1Q13477 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MADCAM1Q13477 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MADCAM1Q13477 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MADCAM1Q13477 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MADCAM1Q13477 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MADCAM1Q13477 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MADCAM1Q13477 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MADCAM1Q13477 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MADCAM1Q13477 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MADCAM1Q13477 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MADCAM1Q13477 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MADCAM1Q13477 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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