Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5R2Q13319 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5R2Q13319 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5R2Q13319 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK5R2Q13319 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5R2Q13319 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5R2Q13319 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5R2Q13319 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5R2Q13319 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5R2Q13319 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5R2Q13319 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5R2Q13319 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5R2Q13319 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5R2Q13319 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5R2Q13319 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
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