Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATMQ13315 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATMQ13315 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATMQ13315 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATMQ13315 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATMQ13315 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATMQ13315 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATMQ13315 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATMQ13315 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATMQ13315 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATMQ13315 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
ATMQ13315 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATMQ13315 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATMQ13315 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATMQ13315 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATMQ13315 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATMQ13315 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATMQ13315 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATMQ13315 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATMQ13315 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATMQ13315 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATMQ13315 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATMQ13315 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATMQ13315 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATMQ13315 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATMQ13315 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATMQ13315 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATMQ13315 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATMQ13315 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMQ13315 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMQ13315 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMQ13315 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMQ13315 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMQ13315 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMQ13315 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMQ13315 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMQ13315 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMQ13315 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATMQ13315 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATMQ13315 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATMQ13315 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATMQ13315 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATMQ13315 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATMQ13315 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATMQ13315 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ATMQ13315 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ATMQ13315 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATMQ13315 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATMQ13315 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATMQ13315 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATMQ13315 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATMQ13315 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATMQ13315 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATMQ13315 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATMQ13315 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATMQ13315 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATMQ13315 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATMQ13315 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATMQ13315 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATMQ13315 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATMQ13315 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATMQ13315 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATMQ13315 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATMQ13315 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATMQ13315 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATMQ13315 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATMQ13315 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATMQ13315 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATMQ13315 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATMQ13315 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATMQ13315 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATMQ13315 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATMQ13315 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATMQ13315 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATMQ13315 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATMQ13315 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATMQ13315 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATMQ13315 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATMQ13315 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATMQ13315 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATMQ13315 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATMQ13315 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATMQ13315 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATMQ13315 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATMQ13315 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATMQ13315 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATMQ13315 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATMQ13315 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATMQ13315 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATMQ13315 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATMQ13315 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATMQ13315 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATMQ13315 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATMQ13315 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATMQ13315 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATMQ13315 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATMQ13315 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATMQ13315 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATMQ13315 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATMQ13315 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
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