Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIK2Q13002 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIK2Q13002 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIK2Q13002 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIK2Q13002 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIK2Q13002 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIK2Q13002 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIK2Q13002 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIK2Q13002 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIK2Q13002 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK2Q13002 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK2Q13002 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK2Q13002 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK2Q13002 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK2Q13002 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK2Q13002 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK2Q13002 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIK2Q13002 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIK2Q13002 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIK2Q13002 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK2Q13002 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK2Q13002 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK2Q13002 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK2Q13002 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK2Q13002 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK2Q13002 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK2Q13002 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK2Q13002 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK2Q13002 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK2Q13002 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK2Q13002 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK2Q13002 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK2Q13002 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK2Q13002 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK2Q13002 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK2Q13002 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK2Q13002 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK2Q13002 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK2Q13002 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK2Q13002 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK2Q13002 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIK2Q13002 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK2Q13002 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK2Q13002 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK2Q13002 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK2Q13002 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK2Q13002 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK2Q13002 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK2Q13002 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK2Q13002 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK2Q13002 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
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