Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFRSF9Q07011 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFRSF9Q07011 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms