Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE3AQ05086 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE3AQ05086 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBE3AQ05086 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE3AQ05086 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3AQ05086 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3AQ05086 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE3AQ05086 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE3AQ05086 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE3AQ05086 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE3AQ05086 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE3AQ05086 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE3AQ05086 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE3AQ05086 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE3AQ05086 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE3AQ05086 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE3AQ05086 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE3AQ05086 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE3AQ05086 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE3AQ05086 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE3AQ05086 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE3AQ05086 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE3AQ05086 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE3AQ05086 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
UBE3AQ05086 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE3AQ05086 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3AQ05086 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3AQ05086 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3AQ05086 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3AQ05086 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3AQ05086 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms