Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APBA1Q02410 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APBA1Q02410 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APBA1Q02410 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
APBA1Q02410 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APBA1Q02410 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APBA1Q02410 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APBA1Q02410 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APBA1Q02410 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APBA1Q02410 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
APBA1Q02410 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
APBA1Q02410 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
APBA1Q02410 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APBA1Q02410 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.52■■■□□ 2
APBA1Q02410 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APBA1Q02410 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
APBA1Q02410 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APBA1Q02410 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APBA1Q02410 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APBA1Q02410 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APBA1Q02410 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APBA1Q02410 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
APBA1Q02410 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APBA1Q02410 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APBA1Q02410 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APBA1Q02410 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APBA1Q02410 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
APBA1Q02410 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APBA1Q02410 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APBA1Q02410 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APBA1Q02410 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
APBA1Q02410 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
APBA1Q02410 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APBA1Q02410 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
APBA1Q02410 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APBA1Q02410 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APBA1Q02410 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
APBA1Q02410 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APBA1Q02410 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms