Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK5Q00535 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5Q00535 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5Q00535 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5Q00535 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms