Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PITX1P78337 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PITX1P78337 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PITX1P78337 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PITX1P78337 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PITX1P78337 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PITX1P78337 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PITX1P78337 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PITX1P78337 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PITX1P78337 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PITX1P78337 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PITX1P78337 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PITX1P78337 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PITX1P78337 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PITX1P78337 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PITX1P78337 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PITX1P78337 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PITX1P78337 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PITX1P78337 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PITX1P78337 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PITX1P78337 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PITX1P78337 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PITX1P78337 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PITX1P78337 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PITX1P78337 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PITX1P78337 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PITX1P78337 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PITX1P78337 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PITX1P78337 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PITX1P78337 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PITX1P78337 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PITX1P78337 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PITX1P78337 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PITX1P78337 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PITX1P78337 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PITX1P78337 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PITX1P78337 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PITX1P78337 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PITX1P78337 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PITX1P78337 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PITX1P78337 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PITX1P78337 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PITX1P78337 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PITX1P78337 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PITX1P78337 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PITX1P78337 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PITX1P78337 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PITX1P78337 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PITX1P78337 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PITX1P78337 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PITX1P78337 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PITX1P78337 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PITX1P78337 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PITX1P78337 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PITX1P78337 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PITX1P78337 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PITX1P78337 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PITX1P78337 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PITX1P78337 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PITX1P78337 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PITX1P78337 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PITX1P78337 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PITX1P78337 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PITX1P78337 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PITX1P78337 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PITX1P78337 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PITX1P78337 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PITX1P78337 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PITX1P78337 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PITX1P78337 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PITX1P78337 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PITX1P78337 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PITX1P78337 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PITX1P78337 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PITX1P78337 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PITX1P78337 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PITX1P78337 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PITX1P78337 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PITX1P78337 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PITX1P78337 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PITX1P78337 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PITX1P78337 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PITX1P78337 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PITX1P78337 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PITX1P78337 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PITX1P78337 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PITX1P78337 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PITX1P78337 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PITX1P78337 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PITX1P78337 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PITX1P78337 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PITX1P78337 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PITX1P78337 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PITX1P78337 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PITX1P78337 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PITX1P78337 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PITX1P78337 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PITX1P78337 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PITX1P78337 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PITX1P78337 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms