Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK2A1P68400 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK2A1P68400 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK2A1P68400 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK2A1P68400 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK2A1P68400 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK2A1P68400 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK2A1P68400 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK2A1P68400 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK2A1P68400 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK2A1P68400 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK2A1P68400 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK2A1P68400 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK2A1P68400 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK2A1P68400 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK2A1P68400 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK2A1P68400 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK2A1P68400 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK2A1P68400 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK2A1P68400 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK2A1P68400 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK2A1P68400 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSNK2A1P68400 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK2A1P68400 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms