Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPD2P62316 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPD2P62316 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPD2P62316 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPD2P62316 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPD2P62316 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPD2P62316 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPD2P62316 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPD2P62316 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPD2P62316 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPD2P62316 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD2P62316 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD2P62316 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD2P62316 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD2P62316 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD2P62316 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD2P62316 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPD2P62316 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPD2P62316 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPD2P62316 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPD2P62316 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPD2P62316 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPD2P62316 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms