Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCE1P61221 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCE1P61221 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCE1P61221 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCE1P61221 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCE1P61221 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCE1P61221 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCE1P61221 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCE1P61221 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCE1P61221 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCE1P61221 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCE1P61221 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCE1P61221 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCE1P61221 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCE1P61221 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCE1P61221 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCE1P61221 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCE1P61221 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCE1P61221 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCE1P61221 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCE1P61221 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCE1P61221 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCE1P61221 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCE1P61221 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCE1P61221 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCE1P61221 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCE1P61221 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCE1P61221 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCE1P61221 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCE1P61221 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCE1P61221 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCE1P61221 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCE1P61221 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCE1P61221 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCE1P61221 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCE1P61221 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCE1P61221 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms