Protein–RNA interactions for Protein: P57076

C21orf59, UPF0769 protein C21orf59, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf59P57076 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C21orf59P57076 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C21orf59P57076 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C21orf59P57076 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C21orf59P57076 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms