Protein–RNA interactions for Protein: P55042

RRAD, GTP-binding protein RAD, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRADP55042 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRADP55042 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRADP55042 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRADP55042 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RRADP55042 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRADP55042 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRADP55042 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRADP55042 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RRADP55042 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRADP55042 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RRADP55042 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRADP55042 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRADP55042 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRADP55042 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRADP55042 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRADP55042 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRADP55042 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRADP55042 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRADP55042 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRADP55042 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRADP55042 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRADP55042 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRADP55042 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRADP55042 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RRADP55042 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRADP55042 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRADP55042 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRADP55042 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRADP55042 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRADP55042 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRADP55042 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRADP55042 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RRADP55042 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRADP55042 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRADP55042 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRADP55042 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRADP55042 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRADP55042 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRADP55042 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRADP55042 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRADP55042 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRADP55042 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRADP55042 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRADP55042 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRADP55042 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRADP55042 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRADP55042 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRADP55042 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRADP55042 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRADP55042 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRADP55042 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRADP55042 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRADP55042 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRADP55042 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRADP55042 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRADP55042 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RRADP55042 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRADP55042 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRADP55042 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRADP55042 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRADP55042 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRADP55042 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRADP55042 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRADP55042 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRADP55042 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRADP55042 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRADP55042 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRADP55042 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRADP55042 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRADP55042 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RRADP55042 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRADP55042 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRADP55042 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRADP55042 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RRADP55042 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRADP55042 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRADP55042 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRADP55042 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRADP55042 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRADP55042 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRADP55042 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRADP55042 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRADP55042 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRADP55042 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRADP55042 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRADP55042 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRADP55042 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRADP55042 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRADP55042 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRADP55042 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRADP55042 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRADP55042 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RRADP55042 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRADP55042 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRADP55042 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRADP55042 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RRADP55042 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RRADP55042 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRADP55042 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRADP55042 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms