Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAA2P54646 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAA2P54646 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAA2P54646 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAA2P54646 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAA2P54646 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAA2P54646 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAA2P54646 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAA2P54646 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAA2P54646 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAA2P54646 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAA2P54646 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAA2P54646 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAA2P54646 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAA2P54646 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAA2P54646 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAA2P54646 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAA2P54646 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAA2P54646 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAA2P54646 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAA2P54646 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKAA2P54646 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAA2P54646 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms