Protein–RNA interactions for Protein: P54619

PRKAG1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAG1P54619 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAG1P54619 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAG1P54619 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAG1P54619 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAG1P54619 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAG1P54619 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAG1P54619 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAG1P54619 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAG1P54619 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKAG1P54619 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRKAG1P54619 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKAG1P54619 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAG1P54619 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms