Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASCL1P50553 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASCL1P50553 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASCL1P50553 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASCL1P50553 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASCL1P50553 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASCL1P50553 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASCL1P50553 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASCL1P50553 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASCL1P50553 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASCL1P50553 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ASCL1P50553 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASCL1P50553 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASCL1P50553 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASCL1P50553 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASCL1P50553 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASCL1P50553 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASCL1P50553 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASCL1P50553 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASCL1P50553 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASCL1P50553 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASCL1P50553 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASCL1P50553 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASCL1P50553 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASCL1P50553 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASCL1P50553 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASCL1P50553 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASCL1P50553 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASCL1P50553 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASCL1P50553 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASCL1P50553 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASCL1P50553 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms