Protein–RNA interactions for Protein: P49821

NDUFV1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFV1P49821 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NDUFV1P49821 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NDUFV1P49821 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NDUFV1P49821 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NDUFV1P49821 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NDUFV1P49821 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDUFV1P49821 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDUFV1P49821 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDUFV1P49821 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NDUFV1P49821 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NDUFV1P49821 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NDUFV1P49821 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NDUFV1P49821 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NDUFV1P49821 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NDUFV1P49821 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NDUFV1P49821 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NDUFV1P49821 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NDUFV1P49821 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NDUFV1P49821 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NDUFV1P49821 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NDUFV1P49821 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NDUFV1P49821 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NDUFV1P49821 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NDUFV1P49821 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NDUFV1P49821 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NDUFV1P49821 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NDUFV1P49821 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NDUFV1P49821 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NDUFV1P49821 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NDUFV1P49821 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NDUFV1P49821 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NDUFV1P49821 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NDUFV1P49821 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NDUFV1P49821 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NDUFV1P49821 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDUFV1P49821 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDUFV1P49821 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDUFV1P49821 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NDUFV1P49821 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDUFV1P49821 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDUFV1P49821 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDUFV1P49821 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDUFV1P49821 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NDUFV1P49821 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NDUFV1P49821 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NDUFV1P49821 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NDUFV1P49821 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NDUFV1P49821 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NDUFV1P49821 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NDUFV1P49821 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NDUFV1P49821 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NDUFV1P49821 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NDUFV1P49821 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NDUFV1P49821 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NDUFV1P49821 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NDUFV1P49821 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NDUFV1P49821 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NDUFV1P49821 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms